流式染色体核型分析的核心原理是:利用流式细胞仪,根据每条染色体独特的DNA含量和碱基组成(AT/GC比例)对其进行物理分离、鉴别和定量。
关键技术步骤与原理分解
1. 样本制备:获取纯净的中期染色体
○ 与制备细胞悬液不同,这里需要的是染色体悬液。
○ 使用特定的药物(如秋水仙碱)将培养的细胞阻滞在分裂中期。
○ 通过低渗处理和机械破碎(如涡旋),使细胞膜破裂,将中期染色体释放出来,形成单条染色体的悬浮液。
2. 染色体染色:双荧光标记
○ Hoechst 33258: 偏爱与DNA的A-T碱基对结合。
○ Chromomycin A3: 偏爱与DNA的G-C碱基对结合。
○ 这是该技术的精髓。使用两种与DNA特异性结合、且荧光特性受DNA碱基组成影响的荧光染料进行染色:
○ 染色时,两种染料会竞争性地与染色体DNA结合。由于每条人类染色体的DNA总量(长度)和AT/GC比例是相对恒定的特征,因此每条染色体结合这两种染料的比例是独特的。
3. 流式细胞仪检测与分选
○ 紫外激光(如351-364nm)激发Hoechst 33258(蓝色荧光)。
○ 氩离子激光(如458nm)激发Chromomycin A3(绿色荧光)。
○ 染色后的染色体悬液被注入流式细胞仪。
○ 在鞘液的包裹下,染色体单行通过检测点,同时被两道激光激发:
○ 探测器分别接收两种荧光信号(FL1-Hoechst, FL2-Chromomycin)。
4. 数据分析:绘制流式核型图
○ 在图上,每条染色体(或同源染色体对)会聚集形成一个独立的“峰”或“簇”。
○ 位置由两个因素决定:荧光总强度反映染色体的大小(DNA含量);两种荧光的强度比值反映染色体的碱基组成(AT/GC比)。
○ 例如,人类1号染色体最大,其总荧光强,会位于图的特定位置;19号染色体虽然较小,但GC含量高,因此Chromomycin信号相对更强,也能与其他小染色体区分开。
○ 仪器记录每条通过“事件”(即每条染色体)的两种荧光信号强度。
○ 将数据以二维散点图或等高线图的形式展示,X轴和Y轴分别代表两种荧光信号的强度(通常经过对数转换)。
○ 结果解读:
○ 通过已知标准样本的比对,可以识别出大多数人类染色体(特别是常染色体,性染色体有时较难完全分开)。
5. 染色体分选(可选但重要)
○ 流式细胞仪可以基于设定的参数(某个特定“峰”),通过液滴充电偏转技术,高速、高纯度地分选出某一条或某一类染色体。
○ 分选出的染色体可用于构建染色体特异性DNA文库、探针制备(如用于FISH)、基因定位等下游研究。
主要优点与局限性
优点:
○ 高速、高通量、客观。
○ 可定量。
○ 具备物理分选能力,为分子生物学研究提供独特工具。
○ 对检测特定的非整倍体(如+8, +21)和标志染色体非常有效。
○ 局限性:
○ 无法检测不改变DNA含量/组成的平衡性结构异常(如相互易位、倒位)。
○ 无法提供染色体形态和带型信息。
○ 某些染色体(如9, 10, 11, 12)因大小和组成相似,可能分群不完全。
○ 需要制备高质量的染色体悬液,技术难度较高。
流式染色体核型分析的原理,本质上是利用流式细胞术对染色体的两个固有物理化学属性——DNA含量和碱基组成——进行高速、定量测量,从而实现对不同染色体的鉴别和分离。
它是传统核型分析的有力补充,特别适用于需要快速分析大量细胞或进行染色体分选的科研场景,但在临床全面诊断复杂染色体结构畸变方面,仍无法替代传统的显微镜核型分析。如今,该技术常与FISH(荧光原位杂交) 和染色体微阵列分析(CMA) 等技术联用,提供更全面的遗传信息。
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